对大部份牙周病患而言，留存在牙龈附近牙颈部的牙菌斑是罪魁祸首。也就是说牙周病是一种慢性细菌感染造成的疾病。如果仔细计算，一毫克的牙菌斑约有一亿个细菌，口腔除牙齿外，黏膜、唾液都是细菌的温床，况且牙菌斑内有十余种毒性很强的厌氧性细菌，这些细菌不但会侵入牙周组织，入侵的细菌本身及其所分泌的毒素，则会激发牙龈组织内强烈的破坏性免疫反应，造成牙龈、牙周韧带和齿槽骨的崩解破坏。
    牙菌斑是造成牙周病的主要元凶，可是下列因素也会影响牙龈的健康：
    抽烟
    香烟内尼古丁会抑制多核性白血球的功能，减少体内对细菌抗体的量，使身体防卫牙周致病菌能力受影响，造成牙周病的恶化及蔓延，抽烟者牙周病治疗也常无法达到预期效果，也有高复发机会。
    怀孕与青春期
妇女在怀孕其间，身体上荷尔蒙改变，会促使牙周病菌数目大量增加，加重原本存有之牙周问题，牙龈发炎的比率因而大增，甚至有些妇女会形成怀孕肉芽肿瘤。停经后妇女患有骨质疏松症者，其下颚骨的骨质密度比没有骨质疏松症妇女来的低许多，且牙齿丧失的数目也较多。
    压力
    药物
    磨牙
    糖尿病
    临床数据指出，45岁以上如果患有糖尿病及抽烟的人，得到严重牙周病的机会，比没有糖尿病，没抽烟的人，多大约20倍。
    其它全身性疾病，如白血病、艾滋病会增加发病机会